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行业动态

T7 RNA聚合酶怎么防止逆转录

  • 作者:admin
  • 发布时间:2020-04-22 11:24
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T7 RNA聚合酶怎么防止逆转录

t7rna

T7 RNA聚合酶易位通过指结构域上的螺旋开口促进,这也可以防止逆转录

在这里,我们通过实施广泛的全原子分子动力学(MD)模拟来构建马尔可夫状态模型(MSM),研究了转录延伸期间DNA上病毒T7 RNA聚合酶(RNAP)易位的完整过程。我们的研究表明,易位以布朗运动进行,RNAP在多个亚稳态之间发生热转移。

我们观察到核酸(NA)链的非同步骨架运动首先完成RNA易位,而模板DNA滞后。值得注意的是,指状结构域上的O-螺旋和Y-螺旋在促进通过螺旋开口的NA易位中起关键作用。螺旋开口允许关键残留物Tyr639插入活性位点,从而推动活性位点RNA- DNA杂交前进。另一个关键残基Phe644通过与转移核苷酸(TN)及其相邻核苷酸堆叠和非堆叠来协调下游模板DNA运动。此外,在易位前(反式前)的O-螺旋开口可能抵抗回溯。为了验证这一假设,我们通过用能够回溯的线粒体RNAP的对应残基取代O-螺旋上的氨基酸来计算设计T7 RNAP的突变体。目前的实验结果支持这一假设。

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