Cas12a的临近基序

 

尿嘧啶介导的新的光空间邻近基序Cas12a在无污染的单拷贝水平上实现可视化的脱氧核糖核酸检测

CRISPR/Cas12a据报道，(cpf1)系统在与靶核酸链结合后不加区别地切割单链核酸。这通常需要靶脱氧核糖核酸链包含TTTN的原间隔基邻近基序序列。在这里，我们发现Cas12a还可以识别UUN的另一个PAM序列，导致其ssDNA侧枝切割效应的激活。为了使这一发现有用，通过与LAMP结合，我们首先实现了CRISPR/Cas12a用于在单拷贝水平上直接可视化的脱氧核糖核酸检测。

通过UDG酶处理，使该系统没有残留扩增子污染，这是该领域的一个大问题。因此，一个超灵敏和抗接触的脱氧核糖核酸检测平台，即UDG和LAMP和CRISPR (ULC)。这一新发现将有助于我们更好地理解Cas12a并扩展其应用。