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行业动态

美研究实验室发现非重复ELSA广泛抑制细菌基因

  • 作者:admin
  • 发布时间:2020-03-03 11:35
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研究实验室发现非重复ELSA广泛抑制细菌基因
sgrna

 

美国宾夕法尼亚大学Howard M. Salis研究组的最新研究,提出使用非重复的超长单向导RNAsgRNA)阵列(ELSAs)能够同时抑制多个细菌基因表达。2019107日,《自然-生物技术》在线发表了这项成果。

他们在非重复ELSAs中稳定表达22sgRNA,同时将最多13个基因抑制在3500倍。他们应用生物物理建模、生物化学表征和机器学习来开发一个非重复性遗传成分工具箱,包括28个结合Cas9sgRNA手柄。他们根据量化DNA合成复杂性,sgRNA表达,sgRNA靶向和遗传稳定性的算法规则,通过组合非重复性遗传部分来设计ELSA。使用ELSA,他们在大肠杆菌中创造了三种高选择性的表型,包括重新定向代谢以增加琥珀酸产量150倍,中断氨基酸生物合成以产生多变性缺陷菌株,以及抑制应激反应以减少持续编程细胞21倍。ELSA能够同时稳定地调节许多基因,以用于代谢工程和合成生物学应用。

据介绍,工程细胞表型通常需要许多基因的调节。当使用CRISPR干扰时,由于重复的脱氧核糖核酸序列的存在,许多sgRNA的共表达将触发遗传不稳定性和表型丢失。

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