我们观察到核酸（NA）链的非同步骨架运动首先完成RNA易位，而模板DNA滞后。值得注意的是，指状结构域上的O-螺旋和Y-螺旋在促进通过螺旋开口的NA易位中起关键作用。螺旋开口允许关键残留物Tyr639插入活性位点，从而推动活性位点RNA- DNA杂交前进。另一个关键残基Phe644通过与转移核苷酸（TN）及其相邻核苷酸堆叠和非堆叠来协调下游模板DNA运动。此外，在易位前（反式前）的O-螺旋开口可能抵抗回溯。为了验证这一假设，我们通过用能够回溯的线粒体RNAP的对应残基取代O-螺旋上的氨基酸来计算设计T7 RNAP的突变体。目前的实验结果支持这一假设。